Kitet används för in vitro kvalitativ detektering av ORF1ab/N/S-generna från det nya coronaviruset 2019-nCoV i andningsprover inklusive orofaryngeala pinnprover, nasofarynxpinnar, sputum och utföra mutationstypning på HV69-70 del samtidigt.Som rapporterats i GISAID-databasen inkluderar mer än 95 % Omicron-variantsekvenser som rapporterats en deletion i HV69-70, vilket kan orsaka ett S-genmålfel (SGTF) i PCR-analyser.SGTF kan användas som en proxymarkör för att screena för Omicron.
Primeruppsättningar och FAM-märkt sond är designade för specifik detektion av ORF-lab-genen av 2019-nCoV, VIC-märkt sond för N-genen från 2019-nCoV, ROX-märkt sond för S-genen HV69-70 del mutation av 2019-nCoV.Human RNase P-gen extraherad samtidigt med testprovet ger en intern kontroll för att validera nukleinextraktionsprocedur och reagensintegritet.Sond som riktar sig mot human RNase P-gen är märkt med CY5.
Realtids PCR-system: Aehealth Diagenex AL, ABI 7500, ViiATM 7, Quant Studio 7 flex.Roche Lightcycler 480, Agilent Mx3000P/3005P, Rotor-GeneTM6000/0.Bio-Rad CEX96 TouchTM SLAN-96S.SLAN-96P, MA 6000;